Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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HERPUD2Q9BSE4 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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