Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
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VGLL1Q99990 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VGLL1Q99990 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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