Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.4 ms