Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPUSD4Q96CM3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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