Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC74AQ96AQ1 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms