Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP53Q70EK8 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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USP53Q70EK8 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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