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Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8
EMB, Embigin, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
EMB
Q6PCB8
MIR1255B1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR103A1-201
ENST00000362165
78 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.213-201
ENST00000364178
111 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
SNORD58C-201
ENST00000365223
64 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC013248.1-201
ENST00000455092
232 nt
TSL 3
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-135P-201
ENST00000516769
101 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
SCARNA16.5-201
ENST00000517114
183 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR4639-201
ENST00000584938
69 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC244669.1-204
ENST00000621564
178 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AP001362.1-201
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124 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-865P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
SNORA50A-201
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BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR34C-201
ENST00000384831
77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNA5SP193-201
ENST00000410353
107 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.630-201
ENST00000411370
108 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
BX276092.1-201
ENST00000427368
251 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR7107-201
ENST00000611489
80 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-1229P-201
ENST00000364295
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR518E-201
ENST00000385252
88 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.586-201
ENST00000391146
98 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR936-201
ENST00000401264
98 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
SNORD71-201
ENST00000411292
86 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC244505.6-201
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130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-1211P-201
ENST00000459179
105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
TRAJ51-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR548H5-201
ENST00000580314
60 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC025166.1-201
ENST00000612411
163 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC243829.6-201
ENST00000612652
106 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MTND5P18-201
ENST00000445624
1801 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.49-201
ENST00000362714
112 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR548D2-201
ENST00000384955
97 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR216A-201
ENST00000385063
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR759-201
ENST00000390224
91 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-971P-201
ENST00000516920
106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
MIR3133-201
ENST00000583157
78 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
VPS35-212
ENST00000640313
141 nt
TSL 5
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-774P-201
ENST00000363238
107 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
SNORD115-24-201
ENST00000363528
82 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.344-201
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112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
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Q6PCB8
Y_RNA.525-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC069271.1-201
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156 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
SNRPGP12-201
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213 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
RNU6-772P-201
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
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Q6PCB8
RNA5SP134-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
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Q6PCB8
AC087277.2-201
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151 nt
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.36
EMB
Q6PCB8
AC138869.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
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Q6PCB8
AC091304.10-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
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Q6PCB8
VTRNA1-3-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU6-1062P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
MIR635-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU7-107P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU7-161P-201
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□□□□□ -2.37
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Q6PCB8
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□□□□□ -2.37
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Q6PCB8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
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Q6PCB8
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Q6PCB8
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EMB
Q6PCB8
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Q6PCB8
RNU4-67P-201
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EMB
Q6PCB8
RNU6-863P-201
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BASIC
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EMB
Q6PCB8
RNU7-10P-201
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MIR6515-201
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Q6PCB8
MIR6755-201
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Q6PCB8
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EMB
Q6PCB8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU6-726P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU6-716P-201
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EMB
Q6PCB8
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EMB
Q6PCB8
SNORD63B-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU7-106P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU6-1006P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
MIR5093-201
ENST00000583199
100 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
CEP290-203
ENST00000547691
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TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.221-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.346-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
Y_RNA.355-201
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BASIC
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Q6PCB8
SNORD50.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
RNU6-1126P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
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Q6PCB8
RNU6-746P-201
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□□□□□ -2.37
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Q6PCB8
RNU6-571P-201
ENST00000384128
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BASIC
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□□□□□ -2.37
EMB
Q6PCB8
MIR599-201
ENST00000385069
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BASIC
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□□□□□ -2.37
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Q6PCB8
RNU7-195P-201
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BASIC
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Q6PCB8
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Q6PCB8
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Q6PCB8
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BASIC
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Q6PCB8
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BASIC
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Q6PCB8
RNU6-815P-201
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BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
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