Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
C9orf135Q5VTT2 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.2 ms