Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GEN1Q17RS7 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.4 ms