Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FXNQ16595 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FXNQ16595 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FXNQ16595 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FXNQ16595 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FXNQ16595 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FXNQ16595 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FXNQ16595 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
FXNQ16595 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FXNQ16595 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FXNQ16595 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FXNQ16595 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FXNQ16595 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
FXNQ16595 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FXNQ16595 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FXNQ16595 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FXNQ16595 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FXNQ16595 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FXNQ16595 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
FXNQ16595 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
FXNQ16595 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FXNQ16595 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FXNQ16595 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FXNQ16595 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FXNQ16595 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
FXNQ16595 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FXNQ16595 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FXNQ16595 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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