Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SLC18A3Q16572 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SLC18A3Q16572 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SLC18A3Q16572 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SLC18A3Q16572 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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