Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SNRNP35Q16560 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms