Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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