Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
VAMP3Q15836 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
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