Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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HERC1Q15751 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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HERC1Q15751 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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