Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.47□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SYCP1Q15431 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
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