Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NCAPHQ15003 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NCAPHQ15003 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms