Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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RAPGEF1Q13905 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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RAPGEF1Q13905 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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RAPGEF1Q13905 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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RAPGEF1Q13905 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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RAPGEF1Q13905 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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RAPGEF1Q13905 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAPGEF1Q13905 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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