Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ITGA9Q13797 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ITGA9Q13797 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ITGA9Q13797 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms