Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
APOFQ13790 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
APOFQ13790 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
APOFQ13790 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
APOFQ13790 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
APOFQ13790 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
APOFQ13790 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
APOFQ13790 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
APOFQ13790 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
APOFQ13790 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
APOFQ13790 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
APOFQ13790 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
APOFQ13790 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
APOFQ13790 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206 ms