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Protein–RNA interactions for Protein: Q13620
CUL4B, Cullin-4B, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4B
Q13620
SNORD50.2-201
ENST00000365465
70 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
SNORD28-201
ENST00000384706
75 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-863P-201
ENST00000515989
104 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
SCARNA16.5-201
ENST00000517114
183 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR4500-201
ENST00000579472
76 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
AC025166.1-201
ENST00000612411
163 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
VPS35-212
ENST00000640313
141 nt
TSL 5
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
SNORA36.1-201
ENST00000363424
132 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-1099P-201
ENST00000363533
107 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
Y_RNA.346-201
ENST00000365385
112 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-1062P-201
ENST00000383908
107 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
SNORA50A-201
ENST00000384225
134 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR598-201
ENST00000384868
97 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR548I2-201
ENST00000408348
149 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
LINC00345-201
ENST00000443679
285 nt
TSL 5
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
AC244505.6-201
ENST00000452829
130 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNA5SP268-201
ENST00000516828
124 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
Y_RNA.703-201
ENST00000516846
111 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIRLET7D-201
ENST00000362263
87 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR548D2-201
ENST00000384955
97 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR216A-201
ENST00000385063
110 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
SNORA68.3-201
ENST00000515906
83 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNA5SP436-201
ENST00000516020
115 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR376B-201
ENST00000614515
100 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
AC243829.3-201
ENST00000622177
108 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
AC091304.10-201
ENST00000641554
121 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNA5SP245-201
ENST00000364239
121 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR635-201
ENST00000384830
98 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR489-201
ENST00000384923
84 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-1307P-201
ENST00000391012
103 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
Y_RNA.586-201
ENST00000391146
98 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
Y_RNA.773-201
ENST00000607168
90 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
SNORA63.5-201
ENST00000363548
123 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-746P-201
ENST00000384112
109 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
SNORD38.2-201
ENST00000384470
69 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-1211P-201
ENST00000459179
105 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-1234P-201
ENST00000516877
103 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
AC244669.1-204
ENST00000621564
178 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MTND5P18-201
ENST00000445624
1801 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
SNORD44.1-201
ENST00000363202
61 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR613-201
ENST00000385248
95 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MT-TR-201
ENST00000387439
65 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
AC013248.1-201
ENST00000455092
232 nt
TSL 3
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
SNORA25.18-201
ENST00000607153
114 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-571P-201
ENST00000384128
107 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
MIR936-201
ENST00000401264
98 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU2-59P-201
ENST00000410482
191 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-735P-201
ENST00000410612
107 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNA5SP227-201
ENST00000516184
113 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
IST1-227
ENST00000626438
126 nt
TSL 5
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CUL4B
Q13620
RNU6-363P-201
ENST00000362895
105 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-80P-201
ENST00000384195
107 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR519A1-201
ENST00000385257
85 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
SUMO1P3-201
ENST00000439961
304 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-772P-201
ENST00000516042
105 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR3133-201
ENST00000583157
78 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
SNORD115-24-201
ENST00000363528
82 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU4-67P-201
ENST00000364569
141 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-1327P-201
ENST00000365302
105 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR34C-201
ENST00000384831
77 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR4711-201
ENST00000578274
70 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
AC243829.6-201
ENST00000612652
106 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
PVT1_3.1-201
ENST00000620853
95 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR1255B1-201
ENST00000636325
63 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
C9orf84-203
ENST00000374287
4721 nt
APPRIS P3
TSL 5
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
AL157777.2-201
ENST00000258070
137 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
Y_RNA.49-201
ENST00000362714
112 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
AC097635.1-201
ENST00000450678
155 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-848P-201
ENST00000515948
107 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-617P-201
ENST00000516147
107 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-473P-201
ENST00000516164
107 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-1049P-201
ENST00000516414
107 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-1018P-201
ENST00000516577
106 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-971P-201
ENST00000516920
106 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR7107-201
ENST00000611489
80 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR7111-201
ENST00000619751
72 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
LEKR1-212
ENST00000640869
237 nt
TSL 5
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-704P-201
ENST00000364162
103 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
Y_RNA.507-201
ENST00000384500
99 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNA5SP193-201
ENST00000410353
107 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
BX276092.1-201
ENST00000427368
251 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
SNRPGP12-201
ENST00000449481
213 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
TRAJ51-201
ENST00000504127
63 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
Y_RNA.712-201
ENST00000517011
92 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-1313P-201
ENST00000362622
102 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-170P-201
ENST00000362832
104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
Y_RNA.344-201
ENST00000365381
112 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-1126P-201
ENST00000384002
107 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNU6-409P-201
ENST00000384114
104 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR1912-201
ENST00000410389
80 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
SNORA7.5-201
ENST00000410672
110 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
Y_RNA.630-201
ENST00000411370
108 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RPL39P34-201
ENST00000477141
156 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
RNA5SP134-201
ENST00000516492
96 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
MIR4679-2-201
ENST00000578358
77 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CUL4B
Q13620
AL512310.12-203
ENST00000640543
90 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
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