Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATRQ13535 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATRQ13535 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATRQ13535 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATRQ13535 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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