Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMAD4Q13485 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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