Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXE3Q13461 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201 ms