Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
XRCC4Q13426 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
XRCC4Q13426 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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