Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SLAMF1Q13291 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SLAMF1Q13291 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SLAMF1Q13291 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.7 ms