Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3FQ13275 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms