Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TRAF3Q13114 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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