Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1AQ13111 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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