Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
IFT88Q13099 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms