Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ECH1Q13011 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ECH1Q13011 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ECH1Q13011 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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