Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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FOXF2Q12947 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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FOXF2Q12947 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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