Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LMAN2Q12907 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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