Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PGGT1BP53609 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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PGGT1BP53609 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PGGT1BP53609 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PGGT1BP53609 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PGGT1BP53609 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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PGGT1BP53609 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PGGT1BP53609 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PGGT1BP53609 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PGGT1BP53609 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PGGT1BP53609 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PGGT1BP53609 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PGGT1BP53609 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PGGT1BP53609 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PGGT1BP53609 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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