Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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USP18Q9UMW8 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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USP18Q9UMW8 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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