Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATG4CQ96DT6 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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