Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC47Q96A33 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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