Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
DDX54Q8TDD1 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms