Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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CHSY3Q70JA7 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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CHSY3Q70JA7 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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CHSY3Q70JA7 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHSY3Q70JA7 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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CHSY3Q70JA7 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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