Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
MSMPQ1L6U9 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MSMPQ1L6U9 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.9 ms