Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRNQ16849 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRNQ16849 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRNQ16849 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRNQ16849 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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