Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPROQ16827 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPROQ16827 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PTPROQ16827 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PTPROQ16827 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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PTPROQ16827 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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PTPROQ16827 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPROQ16827 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPROQ16827 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPROQ16827 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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