Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPE65Q16518 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms