Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKN1Q16512 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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