Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
E2F4Q16254 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
E2F4Q16254 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
E2F4Q16254 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F4Q16254 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
E2F4Q16254 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
E2F4Q16254 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
E2F4Q16254 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F4Q16254 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
E2F4Q16254 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
E2F4Q16254 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E2F4Q16254 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E2F4Q16254 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E2F4Q16254 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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