Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HERPUD1Q15011 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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