Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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GBX1Q14549 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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GBX1Q14549 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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GBX1Q14549 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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GBX1Q14549 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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GBX1Q14549 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GBX1Q14549 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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GBX1Q14549 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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GBX1Q14549 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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