Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NEDD9Q14511 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NEDD9Q14511 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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