Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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CKAP5Q14008 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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