Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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PKP1Q13835 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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PKP1Q13835 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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